生物物理研究所方显杨课题组在《结构生物学的当前观点》发表综述ღ✿◈,全面总结了利用非天然碱基对系统赋能分子标尺技术及其应用ღ✿◈。
随着全球对由RNA病毒引起的病毒性疾病的关注度增加松阪季实子凯发appღ✿◈,如何通过深入理解这些病毒RNA的结构来调控其功能ღ✿◈,发展基于或靶向RNA的新疗法ღ✿◈,成为了当前研究的热点凯发app凯发appღ✿◈。相关分子标尺技术的应用不仅可更准确地理解黄病毒RNA的构象动态变化凯发appღ✿◈,为病毒性疾病的治疗提供新的靶点和策略ღ✿◈,也有望推动RNA纳米技术的发展ღ✿◈,为未来的生物医学研究提供更多可能性ღ✿◈。
RNA分子因其固有的柔性和构象动态凯发appღ✿◈,一直以来都是结构生物学研究中的难点ღ✿◈。传统的结构解析技术凯发appღ✿◈,如X射线晶体学ღ✿◈、核磁共振(NMR)和冷冻电镜松阪季实子ღ✿◈,虽然在解析蛋白质结构方面取得了显著进展ღ✿◈,但在解析RNA结构和捕捉RNA动态变化方面仍面临巨大挑战ღ✿◈。近年来ღ✿◈,人们日益认识到ღ✿◈,多方法联用ღ✿◈、实验数据与计算模拟结合可拓展结构生物学的研究方法和研究思路ღ✿◈。
该综述介绍了3种互补的分子标尺技术松阪季实子ღ✿◈,包括电子顺磁共振(EPR)松阪季实子ღ✿◈、X射线散射干涉(XSI)和荧光共振能量转移的基本原理ღ✿◈,并展示了如何利用NaM-TPT3非天然碱基对系统对长链RNA进行位点特异性标记的方法ღ✿◈,从而实现在纳米尺度上测量RNA分子内和分子间的距离分布松阪季实子ღ✿◈。
该标记方法克服了传统RNA标记技术对RNA的长度和标记位点的限制ღ✿◈,具有反应高效ღ✿◈、纯化步骤简便和无需变性条件等优点ღ✿◈,使得利用分子标尺技术对长链RNA的结构和构象动态开展研究成为可能ღ✿◈。
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